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蛋白质组学听课笔记汇总贴


前言
话说,自从去年年底,小编参加了克里克学院组织的蛋白质组学网络大课堂以来,感觉已经作为酱油成员,登上了蛋白质组学这艘航母,内心是有点小窃喜的~

更让小编开心的是,先后分享出来的十三篇听课笔记,到目前为止一共被阅读了上万次,还有很多小伙伴给小编留言,要么赞扬,要么鼓励,要么一起探讨里面的知识点,让小编觉得码字的所有辛苦都是值得的!

这些听课笔记,是网络课堂的前四堂课的核心知识点,正好从综述、实验、仪器及数据分析四个层面,比较完整地介绍了当前蛋白质组学的基本轮廓和框架。

为了让大伙儿点贴更方便,小编把这十几篇听课笔记做了一个汇总,大伙儿如果想留着慢慢看,重点收藏这个帖子就可以啦~

课程总结
第一课
1
>> 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(上)
知识点:
--基于质谱的蛋白质组学:质谱技术的前世今生
--蛋白定性检测:背景介绍、二级质谱、鉴定碎片离子

2
>> 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述(下)
知识点:
--蛋白定性检测(续):搜库工具、搜库流程、鉴定结果评估
--蛋白定量检测:基于MS1的定量、基于MS2的定量
--靶向蛋白质组学:SRM/MRM、DIA

第二课
1
>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(一)
知识点:
--样品前处理的目的
--样品的收集与保存:组织样品、细胞样品、血清样品
--样品的破碎:机械破碎、物理破碎、化学处理


2
>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(二)
知识点:
--动物组织样品的处理步骤
--动物细胞样品的处理步骤
--石蜡包埋样品的处理步骤
--植物组织样品的处理步骤
--细菌样品的处理步骤
--体液样品的处理步骤
--亚细胞器蛋白的提取方法

3
>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(三)
知识点:
--蛋白提取的质量控制
--脱盐的处理方法
--还原烷基化及酶解的步骤
--蛋白质及肽段的预分级


4
>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理(四)
知识点:
--自动化样品前处理的新方法一:StageTips
--自动化样品前处理的新方法二:PCT压力循环系统


第三课

1
>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(一)
知识点:
--什么是质谱仪
--质谱仪的分类介绍:磁质谱仪、飞行时间质谱仪、四级杆质谱仪、离子阱质谱仪、FTICR和Orbitrap


2
>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(二)
知识点:
--质谱仪性能参数:检测限、线性范围、分辨率和质量准确度
--串联质谱类型及工作原理
--质谱辅助系统

3
>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(三)
知识点:
--液相色谱仪及组成
--液质联用技术

4
>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用(四)
知识点:
--质谱仪的使用与维护
--纳升液相系统的使用与维护
--液质联用系统的检查和保养
--质谱运行状态的评估

第四课
1
>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础(一)
知识点:
--质谱数据格式
--结果报告的质控
--DDA模式的工作原理

2
>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础(二)
知识点:
--同位素对质谱分析的影响
--原始谱图的处理
--什么是b-y离子

3
>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础(三)
知识点:
--DIA数据非依赖性采集
--搜库原理及技巧
--蛋白质组学相关的数据库及使用方法

致谢
最后,感谢此次课程所有的授课老师,感谢他们对知识的分享,以及对听课笔记的审核和把关。也再次谢谢大伙儿的陪伴和鼓励~ 小编通过这次学习,真的长进了很多,也希望对蛋白质组学感兴趣的小伙伴们,也能从小编的笔记中有些小收获。对于蛋白质组学领域的知识,大伙儿还希望学些什么,尽情给我们留言吧~

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